Dvojitý crossing-over

Jednoduchý crossing-over medzi dvoma nesesterskými chromatidami homologických chromozómov produkuje najviac polovicu rekombinantných a polovicu parentálnych genotypov. Pri tvorbe genetických máp treba brať ohľad ako na jednoduchý tak aj na dvojitý crossing-over, keď dochádza k výmene úsekov medzi homologickými chromozómami na viacerých miestach.

Dvojitý crossing-over môže zahŕňať dve, tri alebo všetky štyri chromatidy. Ak prebehne medzi dvoma rovnakými nesesterskými chromatidami, výsledkom sú všetky štyri genotypy parentálneho typu. Ak dvojitý crossing-over zahŕňa tri chromatidy, vzniká 50% parentálnych a 50% rekombinantných genotypov. Ak rekombinácia zasiahne všetky štyri chromatidy, výsledkom je 100% rekombinantných genotypov. Ak vyhodnotíme veľké množstvo meióz na dvojitý crossing-over, výsledkom bude 50% parentálnych a 50% rekombinantných genotypov, čo dokazuje, že maximálny limit rekombinačnej frekvencie je 50% (ako pri voľnej kombinovateľnosti génov na rôznych nehomologických chromozómoch).